สโมสรที่เข้าแข่งขันในฤดูกาล 2564–65 โซนภาคใต้ มีจำนวน 13 สโมสร โดยแบ่งเป็นสโมสรจากฤดูกาล 2563–64 จำนวน 12 สโมสร และสโมสรที่กลับมาส่งทีม หลังแจ้งพักทีมในฤดูกาล 2563–64 จำนวน 1 สโมสร

สนามเหย้า ที่ตั้ง และผลงานฤดูกาลที่แล้ว

สโมสร	ที่ตั้ง	สนามเหย้า	ความจุ	อันดับฤดูกาล 2563–64
กระบี่	กระบี่	สนามกีฬากลางจังหวัดกระบี่	6,000	2
ตรัง	ตรัง	สนามกีฬาเทศบาลนครตรัง	5,000	6
นครศรีฯ ยูไนเต็ด	นครศรีธรรมราช	สนามกีฬาองค์การบริหารส่วนจังหวัดนครศรีธรรมราช	12,000	4
นรา ยูไนเต็ด	นราธิวาส	สนามกีฬาองค์การบริหารส่วนจังหวัดนราธิวาส	7,000	3
ปัตตานี	ปัตตานี	เรนโบว์สเตเดียม	12,000	5
ป่าตอง ซิตี้	ภูเก็ต	สนามกีฬาสุระกุล	16,000	10
พัทลุง	พัทลุง	สนามกีฬาองค์การบริหารส่วนจังหวัดพัทลุง	4,000	12
ยังสิงห์ หาดใหญ่ ยูไนเต็ด	สงขลา (หาดใหญ่)	สนามกีฬาเมืองหลักภาคใต้ (พรุค้างคาว)	3,000	ไม่ได้ส่งทีมเข้าร่วมการแข่งขัน
ยาลอ ซิตี้	ยะลา	จารูสเตเดียม	3,000	7
สตูล ยูไนเต็ด	สตูล	สนามกีฬาองค์การบริหารส่วนจังหวัดสตูล	5,000	9
สงขลา	สงขลา (เมืองสงขลา)	สนามกีฬาติณสูลานนท์	45,000	1
สุราษฎร์ธานี	สุราษฎร์ธานี (เมืองสุราษฎร์ธานี)	สนามกีฬากลางจังหวัดสุราษฎร์ธานี	4,000	11
เอ็มเอชคอน สุราษฎร์ฯ ซิตี้	สุราษฎร์ธานี (เวียงสระ)	สนามกีฬาเทศบาลตำบลบ้านส้อง	2,000	8†

หมายเหตุ

• † สโมสรแข่งขันโดยใช้ชื่อ สุราษฎร์ธานี ซิตี้

ข้อมูลสโมสร

สโมสร	หัวหน้าผู้ฝึกสอน	กัปตันทีม	ผู้ผลิตชุด
กระบี่	ณัฐพงศ์ คงสุข	เอกราช ปั้นแก้ว	นีคอน
ตรัง	อิทธิพล นนท์ศิริ	เอกพงศ์ ทอชุม	โอไอเอ็น
นครศรีฯ ยูไนเต็ด	อัคถภรณ์ ชลิตาภรณ์	สกลวัชร์ สกลหล้า	วอริกซ์
นรา ยูไนเต็ด	สุริยา ยายิ	สุกรี อีแต	ไอแอม
ปัตตานี	ธีรธาดา จำรัส	–	ดูล่า สปอร์ต
ป่าตอง ซิตี้	วรวรรณ ชิตะวณิช	โสภณ พัฒกอ	ทูเอส สปอร์ต
พัทลุง	จารุพงศ์ สังข์พงษ์	สุทธิพงศ์ ไตรถิ่น	วินส์
ยังสิงห์ หาดใหญ่ ยูไนเต็ด	สาธิต เบ็ญโส๊ะ	–	โอเซล
ยาลอ ซิตี้	มุคลิส ตาเเหตาซา	สะการียา กอและ	เอ็มเอส สปอร์ต
สตูล ยูไนเต็ด	ชาคร สระกวี	อนันต์ ยาง๊ะ	โอไอเอ็น
สงขลา	ไดกิ ฮิกุชิ	–	วอริกซ์
สุราษฎร์ธานี	ชัยวัฒน์ เงาอําพันไพฑูรย์	เอกรัตน์ เจริญกุล	โอเซล
เอ็มเอชคอน สุราษฎร์ฯ ซิตี้	ใหญ่ นิลวงษ์	–	มาโบ

ผู้เล่นต่างชาติ

ไทยลีก 3 สามารถขึ้นทะเบียนผู้เล่นต่างชาติได้ไม่เกิน 3 คน โดยสามารถขึ้นทะเบียนสัญชาติใดก็ได้ (ยกเว้นสัญชาติไทย)[2]

Note :
: ผู้เล่นที่ปล่อยตัวระหว่างตลาดซื้อขายนักเตะครั้งที่ 2
: ผู้เล่นที่ลงทะเบียนระหว่างตลาดซื้อขายนักเตะครั้งที่ 2
↔: ผู้เล่นที่มีสองสัญชาติ
→: ผู้เล่นที่ออกจากสโมสรหลังจากลงทะเบียนในเลกแรกหรือเลกที่สอง

	ผู้เล่นต่างชาติทั่วไป
	ผู้เล่นต่างชาติ (เอเชีย)
	ไม่มีการลงทะเบียนผู้เล่นต่างชาติ

สโมสร	เลก	ผู้เล่นรายที่ 1	ผู้เล่นรายที่ 2	ผู้เล่นรายที่ 3
กระบี่	เลกที่ 1	โคเน่ เซย์ดู	โมฮัมเหม็ด ซามีร์	นิโคลัส อบอท
เลกที่ 2
ตรัง	เลกที่ 1	วาลีด อเดล โมฮัมเหม็ด	ซาเดย์ เอสคันดารีคันกาฮี
เลกที่ 2
นครศรีฯ ยูไนเต็ด	เลกที่ 1	ฟิลเลอร์สัน นาธาน	เอรีแวลตู เอมีลียานู ดา ซิลวา	ดิเอโก โอลิวิเอร่า ซิลวา
เลกที่ 2
นรา ยูไนเต็ด	เลกที่ 1	เรียวเฮอิ มาเอดะ	เอ็มมานูเอล เอ็นวาจี
เลกที่ 2
ปัตตานี	เลกที่ 1	สเตฟาโน่ ยูริ	กิลเยร์เม โมไรรา	ไคโอะ โรดริเกซ
เลกที่ 2
ป่าตอง ซิตี้	เลกที่ 1
เลกที่ 2
พัทลุง	เลกที่ 1	มาร์ลอน คอสต้า
เลกที่ 2
ยังสิงห์ หาดใหญ่ ยูไนเต็ด	เลกที่ 1
เลกที่ 2
ยาลอ ซิตี้	เลกที่ 1
เลกที่ 2
สตูล ยูไนเต็ด	เลกที่ 1	ลูคัส มาร์เกวซ	แซมมี่ ซาเมียร์	ดีดีเย เกเร
เลกที่ 2
สงขลา	เลกที่ 1	นาธาน โอลิเวียร่า	อัลแบร์โต โมไรร่า	ฟิลิปเป้ นูเนส
เลกที่ 2
สุราษฎร์ธานี	เลกที่ 1
เลกที่ 2
เอ็มเอชคอน สุราษฎร์ฯ ซิตี้	เลกที่ 1	อาเรมู คาซิม	วินเซนต์ บอสซู	ริคาร์โด้ เปเรซ
เลกที่ 2

การเปลี่ยนแปลงอัตลักษณ์

• สุราษฎร์ธานี ซิตี้ เปลี่ยนชื่อเป็นเอ็มเอชคอน สุราษฎร์ฯ ซิตี้
• หาดใหญ่ ซิตี้ เปลี่ยนชื่อเป็นยังสิงห์ หาดใหญ่ ยูไนเต็ด และมีการเปลี่ยนโลโก้ใหม่[3]

การเปลี่ยนแปลงผู้จัดการทีม

สโมสร	ผู้จัดการทีมที่ออก	สาเหตุที่ออก	วันที่ออก	อันดับในตารางคะแนน	ผู้จัดการทีมที่เข้าแทน	วันที่เข้า
ตรัง	รอยเตอร์ โมไรร่า	หมดสัญญา	มกราคม 2564	ก่อนเริ่มฤดูกาล	อิทธิพล นนท์ศิริ	29 กรกฎาคม 2564[4]
นครศรีฯ ยูไนเต็ด	โชคทวี พรหมรัตน์	อัคถภรณ์ ชลิตาภรณ์	7 พฤษภาคม 2564[5]
นรา ยูไนเต็ด	นิมิตร ลิ่วตระกูล	สุริยา ยายิ	สิงหาคม 2564
ปัตตานี	มาฆะ หอปราสาทสุข	แยกทาง	ธีรธาดา จำรัส	18 มิถุนายน 2564[6]
พัทลุง	วินัย เยี่ยมรัมย์	หมดสัญญา	จารุพงศ์ สังข์พงษ์	14 กรกฎาคม 2564[7]
สตูล ยูไนเต็ด	พิเชษฐ์ สาดีน	ชาคร สระกวี	20 พฤษภาคม 2564[8]
เอ็มเอชคอน สุราษฎร์ฯ ซิตี้	สมชาย สวัสดี	ใหญ่ นิลวงษ์	15 มิถุนายน 2564[9]
สงขลา	อัคถภรณ์ ชลิตาภรณ์	แยกทาง	มีนาคม 2564[10]	ไดกิ ฮิกุชิ	8 พฤษภาคม 2564[11]
ป่าตอง ซิตี้	วลิต จิตบุญชื่น	กรกฎาคม 2564	วรวรรณ ชิตะวณิช	กรกฎาคม 2564